A. 根據《建設工程施工合同（示範文本）》（GF-99-0201）發生工程變更時
根據《建設工程施工合同（示範文本）》（GF-99-0201）發生工程變更時，若合同中已有適用於變更價格，採用合同中單價或價格的情況（A 直接套用）。
說明理由：
合同原文規定：
31.1承包人在工程變更確定後14天內，提出變更工程價款的報告，經工程師確認後調整合同價款。變更合同價款按下列方法進行:
(1)合同中已有適用於變更工程的價格，按合同已有的價格變更合同價款；
(2)合同中只有類似於變更工程的價格，可以參照類似價格變更合同介款；
(3)合同中沒有適用或類似於變更工程的價格，由承包人提出適當的變更價格，經工程師確認後執行。
你問題的原文已經說明了「若合同中已有適用於變更價格」，既然適用，何必再去找麻煩？
另外告訴你一句話，（GF-99-0201）已不再使用，現在使用的是《建設工程施工合同(示範文本)》(GF-2013-0201)。